Родился в Санкт-Петербурге. Младший сын Е. А. Лансере и Е. Н. Бенуа, брат З. Е. Серебряковой. Учился в Высшем художественном училище при Императорской Академии художеств (1898-1904) у дяди — Л. Н. Бенуа.
В сентябре 1917 года Николай Евгеньевич с женой и двумя детьми перебрался в Ростов-на-Дону, где прожил три года.
В Ростове Лансере работал художником на мебельной фабрике, в районной художественной школе, читал лекции по истории архитектуры в Ростовском архелогическом институте.
Лансере зафиксировал на фото 21 архитектурный объект в Ростове и Нахичевани. Есть и серия акварелей художника с видами обоих городов. Некотороые из этих работ побывали на выставке советского искусства в Америке в 1924 году.
Лансере считал необходимым зафиксировать архитектуру Ростова и Нахичевани. Как он считал, эта работа "могла бы дать цельные архитектурные альбомы характерной архитектуры со специально южными приемами и "духом" и послужить громадным подспорьем и научным материалом будущим работам архитекторов и историков края".
2 марта 1931 года Лансере был арестован. 19 января 1932 года осуждён Коллегией ОГПУ по статье 58, ч. 6 и 11 Уголовного кодекса РСФСР за "шпионаж в пользу Франции.